RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 POLIQ9UNA4 740 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 JAG2Q9Y219 1238 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 NR2E1Q9Y466 385 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 SIPA1L1O43166 1804 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 RASA4BC9J798 803 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 RASA4O43374 803 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC22O60826 627 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC6O75061 913 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM155BO75949 473 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 NEBLO76041 1014 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 ASMTLO95671 621 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 FESP07332 822 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM49P0CI25 452 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM49CP0CI26 452 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 NPR1P16066 1061 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT15P19012 456 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 TAC1P20366 129 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 IVDP26440 423 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 MARK3P27448 753 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPN4P29074 926 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 ECE1P42892 770 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 ITGA8P53708 1063 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF6P56537 245 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT76Q01546 638 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 FMO1Q01740 532 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 KLC1Q07866 573 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR44Q5JSH3 913 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 C6orf163Q5TEZ5 329 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 IRGCQ6NXR0 463 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 TRABD2AQ86V40 505 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 C4orf19Q8IY42 314 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 PPFIBP2Q8ND30 876 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXL18Q96ME1 805 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 VPS11Q9H270 941 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM96AQ9H5X1 160 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAM22Q9P0K1 906 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFATQ9P243 1243 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 IP6K2Q9UHH9 426 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 FEM1BQ9UK73 627 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 A6NHS1 94 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM23A6NLE4 172 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 MAFGO15525 162 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 DIAPH2O60879 1101 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 ACSL3O95573 720 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 SERPINB2P05120 415 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 CALB1P05937 261 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT16P08779 473 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 CHRNB2P17787 502 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 VHLP40337 213 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 MAGEA4P43358 317 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 CRKP46108 304 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNJ2P63252 427 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 OCRLQ01968 901 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 MOGSQ13724 837 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT72Q14CN4 511 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 LONRF1Q17RB8 773 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 HHATQ5VTY9 493 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-202ENST00000586851 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms