RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567284.6

FANCA-223, Transcript of FA complementation group A, human

TSL 3

Gene FANCA, Length 479 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FANCA-223	ENST00000567284	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284		A0A1B0GTH6	734 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	HOXA2	O43364	376 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	LRRN2	O75325	713 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	KCNE1	P15382	129 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	GTF2H1	P32780	548 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	MRE11	P49959	708 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	GRIK3	Q13003	919 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SHH	Q15465	462 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	KRT39	Q6A163	491 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	GBP6	Q6ZN66	633 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SEMA4D	Q92854	862 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	TOP1MT	Q969P6	601 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	CASD1	Q96PB1	797 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	YME1L1	Q96TA2	773 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	DERA	Q9Y315	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	PPEF2	O14830	753 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	DGKI	O75912	1065 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	DDHD2	O94830	711 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	VNN1	O95497	513 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	ADCY5	O95622	1261 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	TPM3	P06753	285 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SLC9A1	P19634	815 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	OR1G1	P47890	313 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	ZNF75D	P51815	510 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	AP3M2	P53677	418 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	MYL6	P60660	151 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	CLDN10	P78369	228 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	APBA1	Q02410	837 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	ENPEP	Q07075	957 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	CETN1	Q12798	172 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	NCOA4	Q13772	614 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	NR1I3	Q14994	352 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SYCP1	Q15431	976 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	ZBTB6	Q15916	424 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	ZACN	Q401N2	412 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	XKR4	Q5GH76	650 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SARM1	Q6SZW1	724 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	DRC7	Q8IY82	874 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	HASPIN	Q8TF76	798 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	GCNT4	Q9P109	453 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	COL4A6	Q14031	1691 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	VWA8	A3KMH1	1905 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	PODXL	O00592	558 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	B4GALT3	O60512	393 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	CLCNKB	P51801	687 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	RABGGTB	P53611	331 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	RBP5	P82980	135 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	KCNMA1	Q12791	1236 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	TUSC3	Q13454	348 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	EPC2	Q52LR7	807 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	GJB7	Q6PEY0	223 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	TMC6	Q7Z403	805 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SPC24	Q8NBT2	197 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	TATDN2	Q93075	761 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	SLC9A7	Q96T83	725 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FANCA-223	ENST00000567284	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		10.1	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms