RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564766.1

FUS-208, Transcript of FUS RNA binding protein, human

TSL 2

Gene FUS, Length 791 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FUS-208	ENST00000564766	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	ABCC5	O15440	1437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	KANK1	Q14678	1352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	ERC2	O15083	957 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	SLC5A1	P13866	664 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	INSRR	P14616	1297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	RRM1	P23921	792 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	GPR15	P49685	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62	2e-7	■■□□□ 13.1
FUS-208	ENST00000564766	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	MGAT5	Q09328	741 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	BIRC3	Q13489	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	ICE2	Q659A1	982 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	KIF15	Q9NS87	1388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	HFM1	A2PYH4	1435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766		K7ESF4	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	IL33	O95760	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	LPL	P06858	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	GAA	P10253	952 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	FOXL1	Q12952	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	SPIDR	Q14159	915 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	UGT8	Q16880	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	CT83	Q5H943	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUS-208	ENST00000564766	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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