RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		23.75	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		23.75	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ASIC4	Q96FT7	647 aa		23.75	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	STRA6	Q9BX79	667 aa		23.75	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		23.75	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		23.75	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		23.75	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM221	A6NGB7	291 aa		23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R296	226 aa		23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP6R2	O75170	966 aa		23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R37	O75864	691 aa		23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	STK38	Q15208	465 aa		23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	KYAT1	Q16773	422 aa		23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SV2B	Q7L1I2	683 aa		23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SFR1	Q86XK3	245 aa		23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		23.74	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	OGT	O15294	1046 aa		23.73	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	CLUH	O75153	1309 aa		23.73	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ASGR2	P07307	311 aa		23.73	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	23.73	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1D2	P34982	312 aa		23.73	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		23.73	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	23.73	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	23.73	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		23.73	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SYN3	O14994	580 aa		23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SPTLC2	O15270	562 aa		23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D4	O60343	1298 aa		23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SPAG1	Q07617	926 aa		23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	PANK2	Q9BZ23	570 aa		23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ANK1	P16157	1881 aa		23.72	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	LACTBL1	A8MY62	500 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	TISP43	B9A030	160 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	YEATS4	O95619	227 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP3A5	P20815	502 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	LRPAP1	P30533	357 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	STAT6	P42226	847 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	MTMR3	Q13615	1198 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SUSD3	Q96L08	255 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	23.71	■■□□□ 1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	23.7	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	GAP43	P17677	238 aa		23.7	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		23.7	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		23.7	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	STAM	Q92783	540 aa		23.7	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	HVCN1	Q96D96	273 aa		23.7	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		23.7	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		23.7	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		23.7	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	23.7	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		23.7	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	F13A1	P00488	732 aa		23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	C8A	P07357	584 aa		23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXA9	P31269	272 aa		23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	PKP1	Q13835	747 aa		23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	E2F4	Q16254	413 aa		23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	LIN9	Q5TKA1	542 aa		23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF12	Q96FN5	646 aa		23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	PIDD1	Q9HB75	910 aa		23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	NOTCH4	Q99466	2003 aa		23.69	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	POU2F2	P09086	479 aa		23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNA1	Q09470	495 aa		23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	UVSSA	Q2YD98	709 aa		23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	SHC4	Q6S5L8	630 aa		23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	PDILT	Q8N807	584 aa		23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	MYADM	Q96S97	322 aa		23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNK12	Q9HB15	430 aa		23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	PIEZO1	Q92508	2521 aa		23.68	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	ABLIM3	O94929	683 aa		23.67	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	ADSS	P30520	456 aa		23.67	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	ROR1	Q01973	937 aa		23.67	■■□□□ 1.38
PPP4C-205	ENST00000563200	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		23.67	■■□□□ 1.38

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