RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 MICAL2O94851 1124 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 CFHP08603 1231 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ATF2P15336 505 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 LIG1P18858 919 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 SMTNP53814 917 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 SLC12A3P55017 1021 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ANGPT1Q15389 498 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 TPGS2Q68CL5 300 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 FGF14Q92915 247 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 BORCS6Q96GS4 357 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 SHDQ96IW2 340 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 GDE1Q9NZC3 331 aa20.42■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 H0YCG3 227 aa20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 CDC25AP30304 524 aa20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 MCL1Q07820 350 aa20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 SUSD3Q96L08 255 aa20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 PNMA5Q96PV4 448 aa20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.41■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 PODXLO00592 558 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 FRYLO94915 3013 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ADRB2P07550 413 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 MYBP10242 640 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ANK1P16157 1881 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 MCM2P49736 904 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ROR1Q01973 937 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 PRKCQQ04759 706 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 PARM1Q6UWI2 310 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 TMX3Q96JJ7 454 aa20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 H7C4K7 107 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 SLC16A4O15374 487 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 CCL16O15467 120 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 PIGRP01833 764 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 BRCC3P46736 316 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 NCKAP1LP55160 1127 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 PFKPQ01813 784 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 STRN3Q13033 797 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB6Q15916 424 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 KYAT1Q16773 422 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 TCHPQ9BT92 498 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.39■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 TTC26A0AVF1 554 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 WDR27A2RRH5 827 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ECI2O75521 394 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 BMP15O95972 392 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 CYP3A5P20815 502 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 LRPAP1P30533 357 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ABCD1P33897 745 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ZNF131P52739 623 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 NTHL1P78549 312 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 BEST2Q8NFU1 509 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 PJA1Q8NG27 643 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ITFG1Q8TB96 612 aa20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 M0QZQ0 153 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 CLDN3O15551 220 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 CLTAP09496 248 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 PTPN2P17706 415 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 PAX3P23760 479 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 MAGEA9P43362 315 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 GPC5P78333 572 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ARSHQ5FYA8 562 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 APPL2Q8NEU8 664 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 CA14Q9ULX7 337 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 CEP250Q9BV73 2442 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.37■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 COL4A2P08572 1712 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 SFI1A8K8P3 1242 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 FAM189A1O60320 539 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 OAZ2O95190 189 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 RHOP08100 348 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 PLA2G4BP0C869 781 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 EPHA5P54756 1037 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 OSTNP61366 133 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 LEMD2Q8NC56 503 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.36■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.35■□□□□ 0.85
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