RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 AADACL4Q5VUY2 407 aa3.3□□□□□ -1.88
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JMJD1C-210ENST00000542921 ADAM32Q8TC27 787 aa3.3□□□□□ -1.88
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JMJD1C-210ENST00000542921 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.882e-7■■■□□ 16.9
JMJD1C-210ENST00000542921 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa3.3□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
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