RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SUSD5	O60279	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	STAM2	O75886	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GSTM1	P09488	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CNGA1	P29973	690 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CYP2C19	P33261	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SREBF1	P36956	1147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	UBXN2A	P68543	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CAP1	Q01518	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GHRHR	Q02643	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PGM5	Q15124	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	STXBP2	Q15833	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIB2	Q92519	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	USP6NL	Q92738	828 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	BIN1	O00499	593 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	STX6	O43752	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MSC	O60682	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF205	O95201	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	KCNH1	O95259	989 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CD3E	P07766	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	AFM	P43652	599 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	AMPD2	Q01433	879 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MTMR1	Q13613	665 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	INF2	Q27J81	1249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms