RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 SCNN1GP51170 649 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 CLCN4P51793 760 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 MCL1Q07820 350 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 PSMD2Q13200 908 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ALCAMQ13740 583 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 KCNB1Q14721 858 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 CEP120Q8N960 986 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ZFP42Q96MM3 310 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ACCSQ96QU6 501 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 MIOSQ9NXC5 875 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ARL5CA6NH57 179 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 FAM189A1O60320 539 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 MCF2P10911 925 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 AKAP5P24588 427 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 AVPR2P30518 371 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 OR1G1P47890 313 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 GAD1Q99259 594 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 PRRX2Q99811 253 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 EXOC1Q9NV70 894 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 SNTG2Q9NY99 539 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 A0A0B4J269 797 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 INPPL1O15357 1258 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 TGFB1I1O43294 461 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 MCM4P33991 863 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 LIG4P49917 911 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 GDAQ9Y2T3 454 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 CLDN3O15551 220 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 SOD2P04179 222 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 GRM5P41594 1212 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 SEZ6Q53EL9 994 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 BICD1Q96G01 975 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 B3GALT6Q96L58 329 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 GSDMAQ96QA5 445 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 TCHPQ9BT92 498 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 TMEM206Q9H813 350 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ALDH2P05091 517 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 GLUD2P49448 558 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CAMK4Q16566 473 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 GPR149Q86SP6 731 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 TMEM105Q8N8V8 129 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 KLK14Q9P0G3 267 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 USTQ9Y2C2 406 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 H0Y858 1186 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 TEX28O15482 410 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 LILRB3O75022 631 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 RECQL4O94761 1208 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 BMP6P22004 513 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 OSTNP61366 133 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 DSC1Q08554 894 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 RABGGTAQ92696 567 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 SMARCE1Q969G3 411 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 STK39Q9UEW8 545 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 PARP2Q9UGN5 583 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 UBE4BO95155 1302 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms