RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 PLTPP55058 493 aa10.76□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 MAP2K5Q13163 448 aa10.76□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 EXOC3L1Q86VI1 746 aa10.76□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 ACTRT1Q8TDG2 376 aa10.76□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 SEC14L1Q92503 715 aa10.76□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 GLG1Q92896 1179 aa10.76□□□□□ -0.69
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TRPS1-211ENST00000520276 SEMA6BQ9H3T3 888 aa10.76□□□□□ -0.69
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TRPS1-211ENST00000520276 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
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TRPS1-211ENST00000520276 PORCNQ9H237 461 aa10.75□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 RIC8AQ9NPQ8 531 aa10.75□□□□□ -0.69
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TRPS1-211ENST00000520276 INTUQ9ULD6 942 aa10.75□□□□□ -0.69
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TRPS1-211ENST00000520276 AGTP01019 485 aa10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
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TRPS1-211ENST00000520276 TAAR1Q96RJ0 339 aa10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 SNX24Q9Y343 169 aa10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
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TRPS1-211ENST00000520276 TXKP42681 527 aa10.74□□□□□ -0.69
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TRPS1-211ENST00000520276 HSFX1Q9UBD0 423 aa10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 TXNP10599 105 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 RARBP10826 455 aa10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 SLC18A3Q16572 532 aa10.74□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 CALCRLQ16602 461 aa10.74□□□□□ -0.69
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TRPS1-211ENST00000520276 FAM114A1Q8IWE2 563 aa10.74□□□□□ -0.69
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