RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 GATMP50440 423 aa16.73■□□□□ 0.27
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TRPS1-206ENST00000517323 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.73■□□□□ 0.27
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TRPS1-206ENST00000517323 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
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TRPS1-206ENST00000517323 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa16.7■□□□□ 0.26
TRPS1-206ENST00000517323 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1W2PQJ5 194 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPS1-206ENST00000517323 USP27XA6NNY8 438 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPS1-206ENST00000517323 P4HA2O15460 535 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPS1-206ENST00000517323 ZBTB6Q15916 424 aa16.69■□□□□ 0.26
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