RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516524.1

RNU6-964P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 964, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-964P, Length 69 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP18Q9UMW8 372 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 FYB1O15117 783 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 GLP2RO95838 553 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 MMEP08473 750 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 SCG2P13521 617 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 ATP6V1E1P36543 226 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 COPAP53621 1224 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 AP2B1P63010 937 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 MAMLD1Q13495 774 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 SCARB2Q14108 478 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 EMC10Q5UCC4 262 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CCDC34Q96HJ3 373 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 DPH1Q9BZG8 443 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 EDEM3Q9BZQ6 932 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 RGL1Q9NZL6 768 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 MTRRQ9UBK8 725 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CA14Q9ULX7 337 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CCDC78A2IDD5 438 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 AP3D1O14617 1153 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 PIP5K1BO14986 540 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 ACTL6BO94805 426 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 WISP1O95388 367 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 HSPA4LO95757 839 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 FUCA1P04066 466 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 NFICP08651 508 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 NID1P14543 1247 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 MSH2P43246 934 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 SLC6A11P48066 632 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CCR9P51686 369 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZNF131P52739 623 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 MXRA7P84157 204 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CHAF1BQ13112 559 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 ACVR2BQ13705 512 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 ISM2Q6H9L7 571 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 LIN54Q6MZP7 749 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CHSY3Q70JA7 882 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 YAF2Q8IY57 180 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 YME1L1Q96TA2 773 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 GDF15Q99988 308 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 TSPY26PQ9H489 355 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 STK32BQ9NY57 414 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 GPRASP1Q5JY77 1395 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 STMN1P16949 149 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 MALP21145 153 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 KLRC1P26715 233 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 ACTN2P35609 894 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 SLC13A2Q13183 592 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 BECN1Q14457 450 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 RASA2Q15283 850 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 BAK1Q16611 211 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 C11orf88Q6PI97 169 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 CREG2Q8IUH2 290 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 FLCNQ8NFG4 579 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 EYA3Q99504 573 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 MTG2Q9H4K7 406 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-964P-201ENST00000516524 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms