RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 SYT12Q8IV01 421 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 SYNE4Q8N205 404 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 ABCC5O15440 1437 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 LGALS4P56470 323 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 APBA1Q02410 837 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 XYLT1Q86Y38 959 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 IFT22Q9H7X7 185 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 USP35Q9P2H5 1018 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 HFM1A2PYH4 1435 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 CEP350Q5VT06 3117 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 LEFTY2O00292 366 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 RAB11FIP3O75154 756 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 GASTP01350 101 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 TGM1P22735 817 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 SESN3P58005 492 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 METRNLQ641Q3 311 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 ANKS6Q68DC2 871 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF575Q86XF7 245 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 VRK3Q8IV63 474 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 USP7Q93009 1102 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 STK32BQ9NY57 414 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGEF10O15013 1369 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 DAPK1P53355 1430 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 DLC1Q96QB1 1528 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 TLDC2A0PJX2 215 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 PPFIA4O75335 1185 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ITGA10O75578 1167 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 RECQL4O94761 1208 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 BMP5P22003 454 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ACAP3Q96P50 834 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 SCOCQ9UIL1 159 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 UTRNP46939 3433 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 B5MCH6 92 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 PRAMEF4O60810 478 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ULK1O75385 1050 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ABHD16AO95870 558 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 GCP02774 474 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ENPP1P22413 925 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ADRA1BP35368 520 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 EVA1CP58658 441 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 PTPAQ15257 358 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 UGT8Q16880 541 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 CEP95Q96GE4 821 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 TTC1Q99614 292 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ATP10DQ9P241 1426 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 GAGE12BA1L429 117 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 MST1LQ2TV78 715 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 KCNK18Q7Z418 384 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 CMIPQ8IY22 773 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 TSPEARQ8WU66 669 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 MYOM1P52179 1685 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 NAIPQ13075 1403 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms