RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491153.1

KDM5B-208, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5B, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-208ENST00000491153 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 SUSD3Q96L08 255 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 B3GALT6Q96L58 329 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ACCSQ96QU6 501 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 APOL5Q9BWW9 433 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 PANK2Q9BZ23 570 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 TMEM206Q9H813 350 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 PANK4Q9NVE7 773 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 MUC3AQ02505 3323 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 LACTBL1A8MY62 500 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 H7C4K7 107 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 M0QZQ0 153 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 TBC1D4O60343 1298 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ABLIM3O94929 683 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 CXCL8P10145 99 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 GARTP22102 1010 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 OR1D2P34982 312 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ME1P48163 572 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 PTPN21Q16825 1174 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 SEZ6Q53EL9 994 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 SPATA1Q5VX52 437 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 RESP18Q5W5W9 173 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ADALQ6DHV7 355 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 PALB2Q86YC2 1186 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 PDILTQ8N807 584 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 APPL2Q8NEU8 664 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 HASPINQ8TF76 798 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 STAMQ92783 540 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 TRIM9Q9C026 710 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 MUTYHQ9UIF7 546 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 C2CD2Q9Y426 696 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 MYO7AQ13402 2215 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ANO9A1A5B4 782 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 OAZ2O95190 189 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 IL18RAPO95256 599 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 GCNT3O95395 438 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 IDEP14735 1019 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ATF2P15336 505 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 CMA1P23946 247 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ADSSP30520 456 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 TNFSF9P41273 254 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 BRCC3P46736 316 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 ZXDAP98168 799 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 PKP1Q13835 747 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 LIN9Q5TKA1 542 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 TPGS2Q68CL5 300 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 KANK3Q6NY19 840 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 BEST2Q8NFU1 509 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 POMGNT1Q8WZA1 660 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 NXPE3Q969Y0 559 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 KIF12Q96FN5 646 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-208ENST00000491153 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms