RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	SV2B	Q7L1I2	683 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PALB2	Q86YC2	1186 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXL6	Q8N531	539 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	FIZ1	Q96SL8	496 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH22	Q9UJ99	828 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CLUH	O75153	1309 aa		18.83	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	MYH11	P35749	1972 aa		18.83	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		18.83	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424		H7C4K7	107 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PODXL	O00592	558 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	OGT	O15294	1046 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	GAP43	P17677	238 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	LRPAP1	P30533	357 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	LIG4	P49917	911 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB33	Q86T24	672 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	IQUB	Q8NA54	791 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC15	Q8TF66	581 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	RABGGTA	Q92696	567 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GALT6	Q96L58	329 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CUEDC2	Q9H467	287 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0B4J269	797 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D4	O60343	1298 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	XYLB	O75191	536 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	WEE2	P0C1S8	567 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	AMPD3	Q01432	767 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	LIN9	Q5TKA1	542 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAL	Q6DHV7	355 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	KANK3	Q6NY19	840 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	USP49	Q70CQ1	688 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP57	Q86XR8	500 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	APPL2	Q8NEU8	664 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	BICD1	Q96G01	975 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SUSD3	Q96L08	255 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PANK2	Q9BZ23	570 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	DERA	Q9Y315	318 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIP11	Q15643	1979 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PLXNA3	P51805	1871 aa		18.82	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424		K7ENM7	598 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM189A1	O60320	539 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	RFPL2	O75678	378 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	OSTN	P61366	133 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	TDG	Q13569	410 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ALCAM	Q13740	583 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	POSTN	Q15063	836 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	TPGS2	Q68CL5	300 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PDILT	Q8N807	584 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	HASPIN	Q8TF76	798 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	STRA6	Q9BX79	667 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB7	Q9H672	318 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PIDD1	Q9HB75	910 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		18.81	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ABLIM3	O94929	683 aa		18.8	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1D2	P34982	312 aa		18.8	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		18.8	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		18.8	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		18.8	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		18.8	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424		M0QZQ0	153 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R37	O75864	691 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CMA1	P23946	247 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	18.79	■□□□□ 0.6

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