RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 AXIN1O15169 862 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 OFD1O75665 1012 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PAPLNO95428 1278 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 GALTP07902 379 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP11B2P19099 503 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC11A1P49279 550 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 FNTBP49356 437 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PRKCQQ04759 706 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ECM1Q16610 540 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 AMHR2Q16671 573 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR44Q5JSH3 913 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 UBXN11Q5T124 520 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 KRT79Q5XKE5 535 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PADI6Q6TGC4 694 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CNNM3Q8NE01 707 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 URGCPQ8TCY9 931 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 SHDQ96IW2 340 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CPB2Q96IY4 423 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 KXD1Q9BQD3 176 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CSRNP2Q9H175 543 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 RSAD1Q9HA92 442 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 TBC1D13Q9NVG8 400 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 DACH1Q9UI36 760 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 F5P12259 2224 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PP2D1A8MPX8 630 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 F8W810 466 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TEX28O15482 410 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 B4GALT5O43286 388 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 DDHD2O94830 711 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PRB1P04280 392 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ITGA4P13612 1032 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PDCP20941 246 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 NAMPTP43490 491 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PPP2R5AQ15172 486 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 IL17AQ16552 155 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM187BQ17R55 369 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC27A1Q6PCB7 646 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TPRG1Q6ZUI0 275 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 BRAPQ7Z569 592 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PDZD3Q86UT5 571 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 HACE1Q8IYU2 909 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 BSNDQ8WZ55 320 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 KIFAP3Q92845 792 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TCEAL3Q969E4 200 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 IFT74Q96LB3 600 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 MFRPQ9BY79 579 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RAB23Q9ULC3 237 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 DNM3Q9UQ16 869 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 IPPQ9Y573 584 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.07□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.07□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.07□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1B0GUA9 196 aa7.07□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 VWA3AA6NCI4 1184 aa7.07□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 E9PMD0 336 aa7.07□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 N4BP3O15049 544 aa7.07□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 NPTXRO95502 500 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms