RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 TOR3AQ9H497 397 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-210ENST00000485459 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-210ENST00000485459 CADPSQ9ULU8 1353 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-210ENST00000485459 MARCH11A6NNE9 402 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-210ENST00000485459 ALG1L2C9J202 215 aa5.59□□□□□ -1.51
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RABGGTB-210ENST00000485459 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGGTB-210ENST00000485459 CDC42EP1Q00587 391 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC154A6NI56 674 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGGTB-210ENST00000485459 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-210ENST00000485459 NOMO3P69849 1222 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-210ENST00000485459 COL10A1Q03692 680 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-210ENST00000485459 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.522e-7■□□□□ 9.7
RABGGTB-210ENST00000485459 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
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RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGGTB-210ENST00000485459 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.55□□□□□ -1.52
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RABGGTB-210ENST00000485459 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-210ENST00000485459 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-210ENST00000485459 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-210ENST00000485459 BOD1Q96IK1 185 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-210ENST00000485459 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-210ENST00000485459 Q96MF0 132 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-210ENST00000485459 SYBUQ9NX95 663 aa5.55□□□□□ -1.52
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