RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481348.5

ABCD4-210, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,177 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-210ENST00000481348 K7ENM7 598 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SYN3O14994 580 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 XYLBO75191 536 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 CLTAP09496 248 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 LAMP2P13473 410 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 FSHRP23945 695 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 ABCD1P33897 745 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PTPN5P54829 565 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 RESTQ13127 1097 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SPECC1Q5M775 1068 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PRSS33Q8NF86 280 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 EPSTI1Q96J88 318 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 POLIQ9UNA4 740 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 H7C4K7 107 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 CCL16O15467 120 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PIGRP01833 764 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 CXCL8P10145 99 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 MCM4P33991 863 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 TXLNAP40222 546 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 USP49Q70CQ1 688 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 STK17AQ9UEE5 414 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 TTC26A0AVF1 554 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 OGTO15294 1046 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 POU2F2P09086 479 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 TNFSF9P41273 254 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 NUBP1P53384 320 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SPAG1Q07617 926 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 ZBTB6Q15916 424 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 APPL2Q8NEU8 664 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 KIF12Q96FN5 646 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SUSD3Q96L08 255 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 MTMR6Q9Y217 621 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 A0A0B4J269 797 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 TBC1D4O60343 1298 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 CYP3A5P20815 502 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 LRPAP1P30533 357 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 ELF1P32519 619 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 CLCN5P51795 746 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 ARPP19P56211 112 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 NTHL1P78549 312 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 GTF2BQ00403 316 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 ROR1Q01973 937 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 TCF15Q12870 199 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 DYMQ7RTS9 669 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 DDX12PQ92771 950 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 CLIC6Q96NY7 704 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 FIZ1Q96SL8 496 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 CDH7Q9ULB5 785 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 LACTBL1A8MY62 500 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 ANHXE9PGG2 379 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 PRRG1O14668 218 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 STX6O43752 255 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 FAM189A1O60320 539 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 ABLIM3O94929 683 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 CFHP08603 1231 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 SRFP11831 508 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-210ENST00000481348 ATF2P15336 505 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms