RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 TTPALQ9BTX7 342 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 TEX28O15482 410 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 ZNF202O95125 648 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 CYP3A5P20815 502 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 KLRC2P26717 231 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 BRCC3P46736 316 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 CLCN4P51793 760 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 FAM212AQ96EL1 285 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 S1PR5Q9H228 398 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 MYL1P05976 194 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 PRR29P0C7W0 189 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 FGFR3P22607 806 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 JADE1Q6IE81 842 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SAAL1Q96ER3 474 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 ASB7Q9H672 318 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 FNIP2Q9P278 1114 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 I3L4J1 428 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 LRPAP1P30533 357 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 GUCY2FP51841 1108 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 CEP57Q86XR8 500 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 DERAQ9Y315 318 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 UBE4BO95155 1302 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 TGFB1I1O43294 461 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC3O43617 180 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 ADH1AP07327 375 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 STK4Q13043 487 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 SPATA1Q5VX52 437 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 FAM50BQ9Y247 325 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 EXTL3O43909 919 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 NFICP08651 508 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 WNT7BP56706 349 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 CREMQ03060 361 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 DPYDQ12882 1025 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 PSMD2Q13200 908 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 SUSD6Q92537 303 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 FBXL18Q96ME1 805 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 APOL5Q9BWW9 433 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 EXOC1Q9NV70 894 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 C2CD2Q9Y426 696 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 IL18RAPO95256 599 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 PSMD5Q16401 504 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 GPD1LQ8N335 351 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 BEST2Q8NFU1 509 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 NCOR1O75376 2440 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 PPEF2O14830 753 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 C1RP00736 705 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 KANK3Q6NY19 840 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 PDXDC1Q6P996 788 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 LILRA6Q6PI73 481 aa22.72■■□□□ 1.23
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