RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 SV2BQ7L1I2 683 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 TMC7Q7Z402 723 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 ZNF410Q86VK4 478 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 C4orf19Q8IY42 314 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 ADSSL1Q8N142 457 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 LRRC43Q8N309 656 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 EFHBQ8N7U6 833 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 RNF149Q8NC42 400 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 MTMR9Q96QG7 549 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 TCF25Q9BQ70 676 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 EXOC1Q9NV70 894 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 INTS13Q9NVM9 706 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 SPG21Q9NZD8 308 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.83□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 TECTAO75443 2155 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PQC6 194 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 FSCN2O14926 492 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 N4BP3O15049 544 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 NCK2O43639 380 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 GDF9O60383 454 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 CXCL14O95715 111 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 EOMESO95936 686 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 POMCP01189 267 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 PLCG1P19174 1290 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 CCNE1P24864 410 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 PSMD2Q13200 908 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 CAPSQ13938 189 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 UBXN11Q5T124 520 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 TC2NQ8N9U0 490 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 TRIM9Q9C026 710 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 CHST12Q9NRB3 414 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 USP20Q9Y2K6 914 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 HES2Q9Y543 173 aa6.82□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 KCNJ18B7U540 433 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 B4GALT5O43286 388 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 KLRC4O43908 158 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 TSPAN1O60635 241 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 MFAP3LO75121 409 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 DDHD2O94830 711 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 KIF20AO95235 890 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 WEE2P0C1S8 567 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 CCDC175P0C221 793 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 MYBP10242 640 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 GLRA2P23416 452 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 PRCPP42785 496 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 SLC11A1P49279 550 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 MMP16P51512 607 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 STX17P56962 302 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 ASIC1P78348 528 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 CDC42EP1Q00587 391 aa6.81□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 PLCB3Q01970 1234 aa6.81□□□□□ -1.32
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