RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 MAGEA4P43358 317 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 CDR2Q01850 454 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 MTM1Q13496 603 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SPARCL1Q14515 664 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 MAPK6Q16659 721 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 PLEKHO2Q8TD55 490 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 CD209Q9NNX6 404 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 ANAPC7Q9UJX3 599 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 BANF1O75531 89 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 RNF8O76064 485 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 BMP3P12645 472 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 PTPN4P29074 926 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 ZNF76P36508 570 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 TRAF1Q13077 416 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 LAMB3Q13751 1172 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 EPAS1Q99814 870 aa18.95■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 TBX10O75333 385 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SLITRK3O94933 977 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 RALAP11233 206 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 KCNA3P22001 575 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 CACNA2D1P54289 1103 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 KBTBD2Q8IY47 623 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 CBWD1Q9BRT8 395 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 KANSL3Q9P2N6 904 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 WASF2Q9Y6W5 498 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 GOLGA8IPA6NC78 632 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 GOLGA8JA6NMD2 632 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 TCEA3O75764 348 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 ZCCHC18P0CG32 403 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 ETS1P14921 441 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 VHLP40337 213 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 PIK3CAP42336 1068 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 GABPAQ06546 454 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 CLNKQ7Z7G1 428 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 ITFG2Q969R8 447 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 FGD4Q96M96 766 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 CCDC77Q9BR77 488 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 MKNK1Q9BUB5 465 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 NHSQ6T4R5 1651 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 A0A0G2JND7 137 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 MAGEB2O15479 319 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 GAS8O95995 478 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 PCNX4Q63HM2 1172 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 KLHL11Q9NVR0 708 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SCOCQ9UIL1 159 aa18.94■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 TAF1LQ8IZX4 1826 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 GOLGA8RI6L899 631 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 CYP1A2P05177 515 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 GAP43P17677 238 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 RASA3Q14644 834 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 STAT4Q14765 748 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 PDK4Q16654 411 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 P3H1Q32P28 736 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 IRGCQ6NXR0 463 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 LVRNQ6Q4G3 990 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 ZNF365Q70YC5 407 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 IFT43Q96FT9 208 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 STOML1Q9UBI4 398 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 C1orf220Q5T0J3 134 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 HHATQ5VTY9 493 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 GSTA5Q7RTV2 222 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SLCO2A1Q92959 643 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 VCXQ9H320 206 aa18.93■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 PLS3P13797 630 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 MAPK4P31152 587 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SHMT1P34896 483 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SERPINB4P48594 390 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 VAMP7P51809 220 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 NEK3P51956 506 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 HSPA2P54652 639 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 GPSM2P81274 684 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 MYH11P35749 1972 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SORBS3O60504 671 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 UFL1O94874 794 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 CPA2P48052 419 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 RASSF2P50749 326 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SCYL3Q8IZE3 742 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 ATL2Q8NHH9 583 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SEMA4DQ92854 862 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 SMC6Q96SB8 1091 aa18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PREB-208ENST00000468045 OCEL1Q9H607 264 aa18.92■□□□□ 0.62
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