RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNF19A	Q9NV58	838 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	RAB20	Q9NX57	234 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	PTPRJ	Q12913	1337 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	CIT	O14578	2027 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	POMC	P01189	267 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	KRT19	P08727	400 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	PAX3	P23760	479 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	LRPAP1	P30533	357 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATIC	P31939	592 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	PNPLA4	P41247	253 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	PIK3CA	P42336	1068 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF75D	P51815	510 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	DEFB103A	P81534	67 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	TUSC3	Q13454	348 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	NCOA4	Q13772	614 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	WDR44	Q5JSH3	913 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	LRRC43	Q8N309	656 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAF4B	Q92750	862 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	YME1L1	Q96TA2	773 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	MIOS	Q9NXC5	875 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	GCNT4	Q9P109	453 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	LTBP2	Q14767	1821 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602		H0YGN5	161 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	TEX33	O43247	280 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	GJB5	O95377	273 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADCY5	O95622	1261 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	HLA-DRA	P01903	254 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ITGB3	P05106	788 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	MYO1E	Q12965	1108 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	SYCP1	Q15431	976 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	NAB2	Q15742	525 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	EPC2	Q52LR7	807 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	RASIP1	Q5U651	963 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	IQCD	Q96DY2	449 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM81B	Q96LP2	452 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF560	Q96MR9	790 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	GDF15	Q99988	308 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	SIX4	Q9UIU6	781 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	INSL6	Q9Y581	213 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	PODXL	O00592	558 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	PIR	O00625	290 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	AP5Z1	O43299	807 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLSTN1	O94985	981 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	VNN1	O95497	513 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ALDH2	P05091	517 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	P4HA1	P13674	534 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	PON1	P27169	355 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAF6	P49848	677 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	GUCY2F	P51841	1108 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	DSC1	Q08554	894 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCNMA1	Q12791	1236 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF699	Q32M78	642 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP4-208	ENST00000462602	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		10.11	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms