RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448062.1

RPL23AP28-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP28, Length 470 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP28-201ENST00000448062 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 RAD9AQ99638 391 aa7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 ASB7Q9H672 318 aa7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 CWH43Q9H720 699 aa7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 DPP3Q9NY33 737 aa7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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RPL23AP28-201ENST00000448062 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 TTC3P53804 2025 aa7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 SZT2Q5T011 3432 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 TRANK1O15050 2925 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 ANO9A1A5B4 782 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 I3L4J1 428 aa7.36□□□□□ -1.23
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RPL23AP28-201ENST00000448062 ITGB1P05556 798 aa7.36□□□□□ -1.23
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RPL23AP28-201ENST00000448062 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 BMP8BP34820 402 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 SLC11A1P49279 550 aa7.36□□□□□ -1.23
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RPL23AP28-201ENST00000448062 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 DSC1Q08554 894 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 KCNMA1Q12791 1236 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 SURF1Q15526 300 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 MAN2A1Q16706 1144 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 ZACNQ401N2 412 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 CD302Q8IX05 232 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 URGCPQ8TCY9 931 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 HASPINQ8TF76 798 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 SLC9A7Q96T83 725 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 YME1L1Q96TA2 773 aa7.36□□□□□ -1.23
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RPL23AP28-201ENST00000448062 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.36□□□□□ -1.23
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RPL23AP28-201ENST00000448062 NDST4Q9H3R1 872 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.36□□□□□ -1.23
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RPL23AP28-201ENST00000448062 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 DERAQ9Y315 318 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 C2CD2Q9Y426 696 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 CEP290O15078 2479 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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RPL23AP28-201ENST00000448062 NRP1O14786 923 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 HOXA2O43364 376 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
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RPL23AP28-201ENST00000448062 KIF4AO95239 1232 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 SERPINC1P01008 464 aa7.35□□□□□ -1.23
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RPL23AP28-201ENST00000448062 TNNC2P02585 160 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 CA3P07451 260 aa7.35□□□□□ -1.23
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RPL23AP28-201ENST00000448062 KRT19P08727 400 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 TMEM191BP0C7N4 346 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 OR1G1P47890 313 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 MXI1P50539 228 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 BCAR1P56945 870 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 PLCB2Q00722 1185 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 MYL7Q01449 175 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 LRMPQ12912 555 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 GRIK3Q13003 919 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 TUSC3Q13454 348 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 BIRC3Q13489 604 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 NCOA4Q13772 614 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 NR1I3Q14994 352 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 UPP1Q16831 310 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 EPC2Q52LR7 807 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 GJB7Q6PEY0 223 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 TDHQ8IZJ6 230 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 BEST2Q8NFU1 509 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP28-201ENST00000448062 LMO3Q8TAP4 145 aa7.35□□□□□ -1.23
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