RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 BPIFB4P59827 614 aa14.57□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 PRKG1Q13976 671 aa14.57□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 Q4G0T1 1027 aa14.57□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.57□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 CFAP36Q96G28 342 aa14.57□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 RMDN3Q96TC7 470 aa14.57□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 SLC13A1Q9BZW2 595 aa14.57□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.57□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.57□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 TJP1Q07157 1748 aa14.57□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 PPP2R5DQ14738 602 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 CFAP157Q5JU67 520 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.56□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 CHD4Q14839 1912 aa14.56□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.56□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 HSPH1Q92598 858 aa14.56□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 FAM161BQ96MY7 647 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.56□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 TJP3O95049 919 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 MMP10P09238 476 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 SV2AQ7L0J3 742 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 SNED1Q8TER0 1413 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 LRP6O75581 1613 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 H0YIN7 160 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 EDIL3O43854 480 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 OPHN1O60890 802 aa14.55□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.55□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 ENTPD5O75356 428 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 PSMC4P43686 418 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 ARFIP2P53365 341 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 CAV1Q03135 178 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 MORC4Q8TE76 937 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.55□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 MGRN1O60291 552 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 CYP4X1Q8N118 509 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 PPM1NQ8N819 430 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 MCEEQ96PE7 176 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 SCOCQ9UIL1 159 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 NCANO14594 1321 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 HIF1AQ16665 826 aa14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 SP8Q8IXZ3 490 aa14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 TRIM11Q96F44 468 aa14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 BATF3Q9NR55 127 aa14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 WHRNQ9P202 907 aa14.54□□□□□ -0.08
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