RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 EDN1P05305 212 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLA2G4BP0C869 781 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL17P18621 184 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLCG1P19174 1290 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBA7P41226 1012 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 PFKPQ01813 784 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 DSC1Q08554 894 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRIK3Q13003 919 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 KARSQ15046 597 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 CEP57Q86XR8 500 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLIN2Q99541 437 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIPINQ9BVW5 301 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCND2Q9NZV8 630 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 GIT1Q9Y2X7 761 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 CACNA1AO00555 2505 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 DMXL1Q9Y485 3027 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRIP11Q15643 1979 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1B0GUA9 196 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANHXE9PGG2 379 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 F8W810 466 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 HIP1RO75146 1068 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPP6R2O75170 966 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 XYLBO75191 536 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRRN2O75325 713 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1RP00736 705 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAGEA9P43362 315 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 STARD6P59095 220 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPC5P78333 572 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRKCQQ04759 706 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPP2R5AQ15172 486 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 NFKBIBQ15653 356 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 PARM1Q6UWI2 310 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 HASPINQ8TF76 798 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAD54LQ92698 747 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 FGF14Q92915 247 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNN1Q92952 543 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 CALML4Q96GE6 196 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 BORCS6Q96GS4 357 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 GBP4Q96PP9 640 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR62Q9BZJ7 368 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 C2orf40Q9H1Z8 148 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHST7Q9NS84 486 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDH7Q9ULB5 785 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 COL4A3Q01955 1670 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 TCHHQ07283 1943 aa11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087X0B3 334 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPTLC2O15270 562 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCAM2O15394 837 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPTXRO95502 500 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 C8AP07357 584 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 AKAP5P24588 427 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPTX2P47972 431 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMD5Q16401 504 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF528Q3MIS6 628 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATL3Q6DD88 541 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC27A1Q6PCB7 646 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 RABGGTAQ92696 567 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 DRC1Q96MC2 740 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 MIOSQ9NXC5 875 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 DLL3Q9NYJ7 618 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLK14Q9P0G3 267 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXW11Q9UKB1 542 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 USP18Q9UMW8 372 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF292O60281 2723 aa11.88□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa11.87□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.87□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM170BA6NMN3 283 aa11.87□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACKR2O00590 384 aa11.87□□□□□ -0.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCL16O15467 120 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms