RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 MTSS1LQ765P7 747 aa22.94■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.94■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 FGF13Q92913 245 aa22.94■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 I3L4J1 428 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN3O15551 220 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 PI15O43692 258 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ABLIM3O94929 683 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 NTHL1P78549 312 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ROR1Q01973 937 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ARSHQ5FYA8 562 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 BRAPQ7Z569 592 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 GPR152Q8TDT2 470 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.93■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 NOTCH4Q99466 2003 aa22.92■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.92■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.92■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 H7C4K7 107 aa22.92■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 FGF14Q92915 247 aa22.92■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 SUSD3Q96L08 255 aa22.92■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.92■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 POLIQ9UNA4 740 aa22.92■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.92■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 WDR27A2RRH5 827 aa22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF131P52739 623 aa22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 KYAT1Q16773 422 aa22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 PARM1Q6UWI2 310 aa22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 DTWD2Q8NBA8 298 aa22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 CALML4Q96GE6 196 aa22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 PLIN2Q99541 437 aa22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 CA14Q9ULX7 337 aa22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.91■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 PIGRP01833 764 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 CLTAP09496 248 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ATF2P15336 505 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 UBA7P41226 1012 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 TPGS2Q68CL5 300 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ITFG1Q8TB96 612 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 REEP2Q9BRK0 252 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D17Q9HA65 648 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 MAFFQ9ULX9 164 aa22.9■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.89■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 TTC26A0AVF1 554 aa22.89■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 LRPAP1P30533 357 aa22.89■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ABCD1P33897 745 aa22.89■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.89■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.89■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.89■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.89■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 LRG1P02750 347 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL8P10145 99 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 CYP3A5P20815 502 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ELF1P32519 619 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 STARD6P59095 220 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ANGPT1Q15389 498 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB6Q15916 424 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 SEZ6Q53EL9 994 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF280DQ6N043 979 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 GPBP1Q86WP2 473 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 APPL2Q8NEU8 664 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC15Q8TF66 581 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PARVGQ9HBI0 331 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 GDE1Q9NZC3 331 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP54Q96N23 3096 aa22.88■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PRR23AA6NEV1 266 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 FAM189A1O60320 539 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 MICAL2O94851 1124 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ADRB2P07550 413 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 RHOP08100 348 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 RFX1P22670 979 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 MCM4P33991 863 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 CUL4AQ13619 759 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 RAD54LQ92698 747 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 DDX12PQ92771 950 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 BICD1Q96G01 975 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 SHDQ96IW2 340 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.87■■□□□ 1.25
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