RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CBWD1Q9BRT8 395 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 S1PR5Q9H228 398 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 I3L4J1 428 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLRC2P26717 231 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPL9P32969 192 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRCC3P46736 316 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCFD1Q8WVM8 642 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CASP10Q92851 521 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM212AQ96EL1 285 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SAAL1Q96ER3 474 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTPALQ9BTX7 342 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC39A2Q9NP94 309 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRR29P0C7W0 189 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GARTP22102 1010 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GUCY2FP51841 1108 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JADE1Q6IE81 842 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP57Q86XR8 500 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 APOL5Q9BWW9 433 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF202O95125 648 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NFICP08651 508 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRGAP2BP0DMP2 458 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPL17P18621 184 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYP3A5P20815 502 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FGFR3P22607 806 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WNT7BP56706 349 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRBA2Q6ZNG9 492 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPFIBP1Q86W92 1011 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD302Q8IX05 232 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIK3R5Q8WYR1 880 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM213AQ9BRX8 229 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCIF1Q9H4Z3 704 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FNIP2Q9P278 1114 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TGFB1I1O43294 461 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRPAP1P30533 357 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KMT5BQ4FZB7 885 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KANK3Q6NY19 840 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FEZF2Q8TBJ5 459 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPAN18Q96SJ8 248 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ASB7Q9H672 318 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDH22Q9UJ99 828 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLGA8IPA6NC78 632 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLGA8JA6NMD2 632 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYL1P05976 194 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADH1AP07327 375 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TKTP29401 623 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STK4Q13043 487 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BMT2Q1RMZ1 405 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA1Q5VX52 437 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NELFCDQ8IXH7 590 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA0895Q8NCT3 520 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SUSD6Q92537 303 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXL18Q96ME1 805 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLSTN3Q9BQT9 956 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM50BQ9Y247 325 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EXTL3O43909 919 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DPYDQ12882 1025 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSMD5Q16401 504 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARMCX5Q6P1M9 558 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLYCTKQ8IVS8 523 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD320Q9NPF0 282 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DERAQ9Y315 318 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBE4BO95155 1302 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BDP1A6H8Y1 2624 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPEF2O14830 753 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADAM12O43184 909 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAPPC3O43617 180 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM132DQ14C87 1099 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PALB2Q86YC2 1186 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRSK2Q8IWQ3 736 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EFCAB13Q8IY85 973 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ENGASEQ8NFI3 743 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EXOC1Q9NV70 894 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DZANK1Q9NVP4 752 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C2CD2Q9Y426 696 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUB1Q9Y5A7 615 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VWA8A3KMH1 1905 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LDHAP00338 332 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPN1P04843 607 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LILRA6Q6PI73 481 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BEST2Q8NFU1 509 aa27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms