RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 TRIM29Q14134 588 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 TMEM240Q5SV17 173 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 RPTNQ6XPR3 784 aa7.45□□□□□ -1.22
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CCL20-202ENST00000409189 FERMT3Q86UX7 667 aa7.45□□□□□ -1.22
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CCL20-202ENST00000409189 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 SOCS4Q8WXH5 440 aa7.45□□□□□ -1.22
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CCL20-202ENST00000409189 SMCHD1A6NHR9 2005 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 FAM186AA6NE01 2351 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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CCL20-202ENST00000409189 CLTBP09497 229 aa7.44□□□□□ -1.22
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CCL20-202ENST00000409189 RGS2P41220 211 aa7.44□□□□□ -1.22
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CCL20-202ENST00000409189 TROAPQ12815 778 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 SPP2Q13103 211 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 CCDC183Q5T5S1 534 aa7.44□□□□□ -1.22
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CCL20-202ENST00000409189 GPR142Q7Z601 462 aa7.44□□□□□ -1.22
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CCL20-202ENST00000409189 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.44□□□□□ -1.22
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CCL20-202ENST00000409189 HERVK_113Q902F9 699 aa7.43□□□□□ -1.22
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CCL20-202ENST00000409189 IDI2Q9BXS1 227 aa7.43□□□□□ -1.22
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CCL20-202ENST00000409189 KBTBD13C9JR72 458 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 H0Y8X5 98 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CCL20-202ENST00000409189 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
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