RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 PP2D1A8MPX8 630 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 SYN3O14994 580 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 SP9P0CG40 484 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 PTPN2P17706 415 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 TKTP29401 623 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 CDC25AP30304 524 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 SMTNP53814 917 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 PEX3P56589 373 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 IQCEQ6IPM2 695 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 BRAPQ7Z569 592 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 IGSF22Q8N9C0 903 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 R4GN57 208 aa15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 PATJQ8NI35 1801 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 PODXLO00592 558 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ECI2O75521 394 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 MCF2P10911 925 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 PRPHP41219 470 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 OSTNP61366 133 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 PPP2R5DQ14738 602 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ZNF528Q3MIS6 628 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 CYP4A22Q5TCH4 519 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 NT5DC1Q5TFE4 455 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 APPL2Q8NEU8 664 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ITFG1Q8TB96 612 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 RUBCNQ92622 972 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 KXD1Q9BQD3 176 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 FOXQ1Q9C009 403 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 FBXO4Q9UKT5 387 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 MAFFQ9ULX9 164 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 USP20Q9Y2K6 914 aa15.36■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 FAM170BA6NMN3 283 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 H0YCG3 227 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ADAM12O43184 909 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 STX6O43752 255 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 HIP1RO75146 1068 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 RHOP08100 348 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 NPTX2P47972 431 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ARPP19P56211 112 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 TPGS2Q68CL5 300 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 SLC8B1Q6J4K2 584 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 MPZL3Q6UWV2 235 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ING5Q8WYH8 240 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 CDT1Q9H211 546 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 CYP4F11Q9HBI6 524 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 CLIC4Q9Y696 253 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa15.35■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 NOTCH4Q99466 2003 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 SPTLC1O15269 473 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ATF2P15336 505 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 KCNE1P15382 129 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 MCM4P33991 863 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 BRCC3P46736 316 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ROR1Q01973 937 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 GRIN1Q05586 938 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ZNF280DQ6N043 979 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 LEMD2Q8NC56 503 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ELSPBP1Q96BH3 223 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 MCRS1Q96EZ8 462 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 CORO1BQ9BR76 489 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 ZFP14Q9HCL3 533 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.34■□□□□ 0.05
CITED1-202ENST00000373619 VWA3AA6NCI4 1184 aa15.33■□□□□ 0.04
CITED1-202ENST00000373619 I3L4J1 428 aa15.33■□□□□ 0.04
CITED1-202ENST00000373619 MAN2B1O00754 1011 aa15.33■□□□□ 0.04
CITED1-202ENST00000373619 XPOTO43592 962 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
CITED1-202ENST00000373619 MICAL2O94851 1124 aa15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms