RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 HKR1P10072 659 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 RBP3P10745 1247 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 MGAT1P26572 445 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 CD38P28907 300 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 LSSP48449 732 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRC-204ENST00000367379 GUCY1B3Q02153 619 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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PTPRC-204ENST00000367379 ITGA10O75578 1167 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
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PTPRC-204ENST00000367379 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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PTPRC-204ENST00000367379 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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PTPRC-204ENST00000367379 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.59□□□□□ -1.35
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PTPRC-204ENST00000367379 KDM1AO60341 852 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRC-204ENST00000367379 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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PTPRC-204ENST00000367379 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-204ENST00000367379 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-204ENST00000367379 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-204ENST00000367379 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-204ENST00000367379 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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