RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 ABCD1P33897 745 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 STAT6P42226 847 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ZXDAP98168 799 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 STK38Q15208 465 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PTPN21Q16825 1174 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SEZ6Q53EL9 994 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 RRAGBQ5VZM2 374 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 EDAQ92838 391 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 A0A087X0B3 334 aa8.35□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.35□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 I3L4J1 428 aa8.35□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SPTLC2O15270 562 aa8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC3O43617 180 aa8.35□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 FAM189A1O60320 539 aa8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 KYAT1Q16773 422 aa8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 FIZ1Q96SL8 496 aa8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 MTRRQ9UBK8 725 aa8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 USTQ9Y2C2 406 aa8.35□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SCN1AP35498 2009 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 NOTCH4Q99466 2003 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0B4J269 797 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TTC26A0AVF1 554 aa8.34□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 SIGLEC14Q08ET2 396 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 MTMR3Q13615 1198 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PDILTQ8N807 584 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 STAMQ92783 540 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 HVCN1Q96D96 273 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.34□□□□□ -1.07
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