RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ACKR2O00590 384 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB39O15060 712 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0355O15063 1070 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CTAGE5O15320 804 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CFIP05156 583 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL8P10145 99 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PLS3P13797 630 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FSHRP23945 695 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A12Q504Y0 691 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 TAF3Q5VWG9 929 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 BBS5Q8N3I7 341 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 HPDLQ96IR7 371 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NECTIN4Q96NY8 510 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 EPC1Q9H2F5 836 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 BRWD1Q9NSI6 2320 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 MUC6Q6W4X9 2439 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF202O95125 648 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 PNPLA4P41247 253 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NPTX2P47972 431 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GPR158Q5T848 1215 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 GPD1LQ8N335 351 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTS4O75173 837 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH1A2O94788 518 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ADCY5O95622 1261 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 EOMESO95936 686 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PTPN2P17706 415 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CTGFP29279 349 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NUMBP49757 651 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RARRES1P49788 294 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 EPHB1P54762 984 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PFKPQ01813 784 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 CCDC51Q96ER9 411 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 VPS16Q9H269 839 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 DSEQ9UL01 958 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 LAMB1P07942 1786 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CACNA1BQ00975 2339 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CAND2O75155 1236 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PDIA5Q14554 519 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 LPIN1Q14693 890 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ELF2Q15723 593 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SERINC5Q86VE9 423 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 B3GALT6Q96L58 329 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TIPINQ9BVW5 301 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NLRC4Q9NPP4 1024 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SEL1LQ9UBV2 794 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 EML1O00423 815 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GRM6O15303 877 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CBFA2T2O43439 604 aa4.75□□□□□ -1.65
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