RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 AP2B1P63010 937 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 EFHBQ8N7U6 833 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 UBA3Q8TBC4 463 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 AURKCQ9UQB9 309 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SLC1A1P43005 524 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM9Q9C026 710 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PPP3CCP48454 512 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 KDM4CQ9H3R0 1056 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PQC6 194 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 OR1G1P47890 313 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 KCNB1Q14721 858 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ETFBP38117 255 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 IER5Q5VY09 327 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 GLI2P10070 1586 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SOX11P35716 441 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 FMO5P49326 533 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 C16orf87Q6PH81 154 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC1Q9BTT6 524 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ATL2Q8NHH9 583 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SPON1Q9HCB6 807 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 NR3C2P08235 984 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 OCA2Q04671 838 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 NUP93Q8N1F7 819 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ENO1P06733 434 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 CHP1Q99653 195 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 HPS4Q9NQG7 708 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 C19orf81C9J6K1 198 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 LPAR1Q92633 364 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ZFYVE19Q96K21 471 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 MED15Q96RN5 788 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 RAB6BQ9NRW1 208 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 WEE2P0C1S8 567 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PKN3Q6P5Z2 889 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 TIPINQ9BVW5 301 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 STK33Q9BYT3 514 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 TRABDQ9H4I3 376 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF609O15014 1411 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 TET3O43151 1660 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 LONRF1Q17RB8 773 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 KRT72Q14CN4 511 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 MYMKA6NI61 221 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H2ADP20671 130 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H2AJQ99878 128 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 H2AFJQ9BTM1 129 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 NPTXRO95502 500 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 KDSRQ06136 332 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 PTPRN2Q92932 1015 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 ABHD8Q96I13 439 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 FAM167BQ9BTA0 163 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 TSSK1BQ9BXA7 367 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 STXBP3O00186 592 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 GUCY1A3Q02108 690 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 SMTNL2Q2TAL5 461 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.358e-6■■□□□ 11.6
PTPRM-201ENST00000332175 DOLKQ9UPQ8 538 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 C2CD2LO14523 706 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 GALCP54803 685 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA4Q8NEY3 305 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 WDR24Q96S15 920 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 DPYDQ12882 1025 aa23.5■■□□□ 1.35
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