RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-201ENST00000250495 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-201ENST00000250495 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-201ENST00000250495 DTWD2Q8NBA8 298 aa23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-201ENST00000250495 FGF13Q92913 245 aa23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-201ENST00000250495 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-201ENST00000250495 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 PARM1Q6UWI2 310 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 FGF14Q92915 247 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 CALML4Q96GE6 196 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ABLIM3O94929 683 aa23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 UBA7P41226 1012 aa23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ROR1Q01973 937 aa23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 MCL1Q07820 350 aa23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ITFG1Q8TB96 612 aa23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D17Q9HA65 648 aa23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGEF3Q9NR81 526 aa23■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 BMP15O95972 392 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 SCP2P22307 547 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ANGPT1Q15389 498 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ARSHQ5FYA8 562 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 SHDQ96IW2 340 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D4O60343 1298 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 LRG1P02750 347 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 CLTAP09496 248 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ATF2P15336 505 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 PTPN2P17706 415 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 NCKAP1LP55160 1127 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 GPC5P78333 572 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 SEZ6Q53EL9 994 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 APPL2Q8NEU8 664 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 KCNN1Q92952 543 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 BICD1Q96G01 975 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 SUSD3Q96L08 255 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 WDR27A2RRH5 827 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 PRRG1O14668 218 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 MCM4P33991 863 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ARPP19P56211 112 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 KYAT1Q16773 422 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 TPGS2Q68CL5 300 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 GDE1Q9NZC3 331 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 NOTCH4Q99466 2003 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 RHOP08100 348 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF280DQ6N043 979 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 BRAPQ7Z569 592 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 GPBP1Q86WP2 473 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 MYCT1Q8N699 235 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 MAFFQ9ULX9 164 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-201ENST00000250495 PRR23AA6NEV1 266 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 CXCL8P10145 99 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 LIG4P49917 911 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 STARD6P59095 220 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 PFKPQ01813 784 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 DDX12PQ92771 950 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 REEP2Q9BRK0 252 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 PARVGQ9HBI0 331 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 TBX20Q9UMR3 447 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 USP34Q70CQ2 3546 aa22.94■■□□□ 1.26
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