RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000186832.1

Ccl20-203, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 772 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Slc13a4Q8BZ82 625 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 H6pdQ8CFX1 789 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Pop1Q8K205 1045 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Mmgt1Q8K273 131 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 TxlnbQ8VBT1 685 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Olfr390Q8VEZ7 311 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Ctu1Q99J10 420 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Asb11Q9CQ31 323 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Cep72Q9D3R3 646 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 PrameQ9D4Z5 464 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 1700016D06RikQ9DAA5 166 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Eif4e3Q9DBB5 207 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Uchl3Q9JKB1 230 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Nudt5Q9JKX6 218 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 EmcnQ9R0H2 261 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Angptl3Q9R182 455 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Atp1a4Q9WV27 1032 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Zgrf1Q0VGT4 1863 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Kmt2eQ3UG20 1868 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Col24a1Q30D77 1733 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Col4a3Q9QZS0 1669 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Zfp457L7N1X4 647 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 GclmO09172 274 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Tnfrsf18O35714 228 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Cops5O35864 334 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 XlrP05531 208 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Gna15P30678 374 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Grm1P97772 1199 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 HmmrQ00547 794 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 ItpripQ3TNL8 555 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Q3TTJ4 293 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Nat8lQ3UGX3 299 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 ItgadQ3V0T4 1168 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Miga1Q4QQM5 600 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Arhgap1Q5FWK3 439 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Icam5Q60625 917 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 LbpQ61805 481 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 FAM120AQ6A0A9 1112 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Nudt16Q6P3D0 195 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Adam39Q7M762 756 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Trim65Q8BFW4 522 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Depdc1bQ8BH88 529 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Pnpla2Q8BJ56 486 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Hook3Q8BUK6 718 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Upb1Q8VC97 393 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Nmrk1Q91W63 195 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 VillQ91YD6 859 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Ubxn1Q922Y1 297 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Tlr3Q99MB1 905 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Ms4a8Q99N10 290 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 IscuQ9D7P6 168 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Tcirg1Q9JHF5 834 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Serpinb6cW4VSP4 379 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Pds5aQ6A026 1332 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Robo3Q9Z2I4 1366 aa9.49□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Fam71aB7XG49 585 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Zfp266E9Q2S7 604 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Gm10801F7C7Q0 168 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Prom1O54990 867 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Xirp1O70373 1129 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 AfmO89020 608 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Mt-CybP00158 381 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 P01648 108 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Rps6ka1P18653 724 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Phka1P18826 1241 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Lmnb2P21619 596 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Pik3caP42337 1068 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Gfpt1P47856 697 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Tnnt2P50752 301 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Ptgs2Q05769 604 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Drp2Q05AA6 957 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Tfdp1Q08639 410 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Trim72Q1XH17 477 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Tgfbrap1Q3UR70 860 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Fam189a2Q4FZH1 290 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Rhox12Q4TU81 186 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Ccdc157Q5SPX1 718 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Q66JV7 365 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Frmd5Q6P5H6 517 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 NfrkbQ6PIJ4 1296 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Tlr11Q6R5P0 926 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Rnf139Q7TMV1 668 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Tas2r134Q7TQB0 298 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 RubcnQ80U62 956 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Map3k11Q80XI6 850 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccl20-203ENSMUST00000186832 Kat5Q8CHK4 513 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.1 ms