RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105255.2

Ctdsp2-201, Transcript of Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdsp2, Length 4,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Wdr18Q4VBE8 431 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 EsrrbQ61539 433 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Zfp943Q6NZP4 507 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Slc38a7Q8BWH0 463 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Senp2Q91ZX6 588 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Pdk2Q9JK42 407 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 PolkQ9QUG2 852 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Grk1Q9WVL4 564 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Sbf2E9PXF8 1872 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Rbp3P49194 1234 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Gm10488Q4KL05 212 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Q8BGD0 127 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Alg1Q921Q3 482 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 IscuQ9D7P6 168 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Slc40a1Q9JHI9 570 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Znhit2Q9QY66 399 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Gadd45gQ9Z111 159 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Sept3Q9Z1S5 350 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Gm3415J3QMS8 315 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Tnnc2P20801 160 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Morf4l1P60762 362 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Acsbg2Q2XU92 667 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Zmym1Q3TJB1 983 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Upf3bQ3ULL6 472 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Git1Q68FF6 770 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Snx14Q8BHY8 964 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 MafaQ8CF90 359 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Rpp40Q8R1F9 363 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Gm3404Q9D506 307 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 RptorQ8K4Q0 1335 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 EloblA6PWE0 161 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 TyrobpO54885 114 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Pgk2P09041 417 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Klra1P20937 262 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Usp4P35123 962 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Ccr1P51675 355 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Nub1P54729 614 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Zscan2Q07230 614 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Pdlim7Q3TJD7 457 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Srebf2Q3U1N2 1130 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Ctnna2Q61301 953 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Adcy2Q80TL1 1090 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Map1sQ8C052 973 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Mamdc2Q8CG85 686 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Mbtps2Q8CHX6 515 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 PdgfcQ8CI19 345 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Vps37cQ8R105 352 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 PdgfdQ925I7 370 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Psmd6Q99JI4 389 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Cep72Q9D3R3 646 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Krt71Q9R0H5 524 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Cetn2Q9R1K9 172 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Lrrc63A6H694 637 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Gm4846B2RWH8 538 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Il27raO70394 623 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Aoc3O70423 765 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Rad54lP70270 747 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Sco1Q5SUC9 284 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 LbpQ61805 481 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Retreg2Q6NS82 541 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Snx19Q6P4T1 997 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Znf507Q6ZPY5 941 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Neto2Q8BNJ6 525 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Plcb4Q91UZ1 1175 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Ndufab1Q9CR21 156 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Thap12Q9CUX1 758 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Ttc13A0A1L1SSC7 844 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Capn2O08529 700 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Clk2O35491 499 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Tbx3P70324 741 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Gm1587Q3UT80 123 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Trim37Q6PCX9 961 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Pxylp1Q8BHA9 480 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Fam49aQ8BHZ0 323 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Ccser1Q8C0C4 895 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Actl9Q8CG27 415 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 LgsnQ8CIX8 563 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Mettl7bQ9DD20 244 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 B4galt5Q9JMK0 388 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Snx1Q9WV80 522 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Speer2E9Q9U2 264 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Becn2P0DM65 447 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Wee1P47810 646 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Adcy8P97490 1249 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 ZbbxQ0P5X5 716 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Tex35Q14BK3 207 aa9.25□□□□□ -0.93
Ctdsp2-201ENSMUST00000105255 Kansl1lQ5DTI6 991 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.3 ms