RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Grpel1Q99LP6 217 aa17.2■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spata17Q9D552 379 aa17.2■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 IscuQ9D7P6 168 aa17.2■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 GraspQ9JJA9 392 aa17.2■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Egfl7Q9QXT5 275 aa17.2■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc26a3Q9WVC8 757 aa17.2■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm6133B2RY53 190 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 PtgisO35074 501 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pitpnm1O35954 1243 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 ZfxP17012 799 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 FechP22315 420 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Xrcc5P27641 732 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rad54lP70270 747 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sh3bp2Q06649 559 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Palb2Q3U0P1 1104 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sorbs1Q62417 1290 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cd300aQ6SJQ0 318 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gucy2gQ6TL19 1100 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wscd1Q80XH4 572 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 IntS13Q8QZV7 732 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ube2sQ921J4 223 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lrrc71Q9D3W5 558 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 PirQ9D711 290 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rnf225Q9D7D1 332 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trim54Q9ERP3 366 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Stk4Q9JI11 487 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 ThegQ9JMB1 375 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ripk3Q9QZL0 486 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn2r121A2BE32 847 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm3127E9Q9P5 263 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm3453K7N724 263 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pja1O55176 578 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 EgfP01132 1217 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cd44P15379 778 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 MsnP26041 577 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ptpn11P35235 597 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gfpt1P47856 697 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Znf367Q0VDT2 340 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Echdc2Q3TLP5 296 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Has1Q61647 583 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ints2Q80UK8 1198 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gpc3Q8CFZ4 579 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 BbxQ8VBW5 907 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rrp1bQ91YK2 724 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam76aQ922G2 307 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wfdc1Q9ESH5 211 aa17.19■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Snx12O70493 165 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdh8P97291 799 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gse1Q3U3C9 1213 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam92bQ3V2J0 292 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Papd7Q6PB75 542 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Reps2Q80XA6 521 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdc23Q8BGZ4 597 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ttc16Q8C1F5 767 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rftn2Q8CHX7 500 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lrrc45Q8CIM1 670 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Unc93b1Q8VCW4 598 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Setd3Q91WC0 594 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smc1bQ920F6 1248 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tom1l1Q923U0 474 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dock3Q8CIQ7 2027 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm12394A2AKP6 982 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm4297D3YWB7 211 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm10721J3QPJ9 223 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cbfa2t2O70374 594 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 JchainP01592 159 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rrm1P07742 792 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gjc1P28229 396 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 LipeP54310 759 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Paxbp1P58501 919 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 EnahQ03173 802 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Inppl1Q6P549 1257 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Krit1Q6S5J6 736 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ube2q1Q7TSS2 422 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Akirin1Q99LF1 191 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ctnnbl1Q9CWL8 563 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Creld2Q9CYA0 350 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 B4galt4Q9JJ04 344 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 ChmQ9QXG2 665 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc4a11A2AJN7 862 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pate3B3GLJ3 98 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfr2E9Q5M4 874 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 4933406M09RikG3XA12 479 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Shmt1P50431 478 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nek10Q3UGM2 1111 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Skap1Q3UUV5 355 aa17.17■□□□□ 0.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Crhr2Q60748 411 aa17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18 ms