RNA–Protein interactions for RNA: YPR175W

DPB2, Transcript of Second largest subunit of DNA polymerase II (DNA polymerase epsilon), yeast

Gene DPB2, Length 2,070 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DPB2	YPR175W	TPO4	Q12256	659 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	TSC11	P40061	1430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	FZO1	P38297	855 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	MCM22	P47167	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	HOP2	P53187	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	AAH1	P53909	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	TSA2	Q04120	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	JLP1	Q12358	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	ERD2	P18414	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	PPH21	P23594	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
DPB2	YPR175W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	BMT5	P40493	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	NUP57	P48837	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	MRH4	P53166	561 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	PEX10	Q05568	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	DXO1	Q06349	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	SGE1	P33335	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	CSG2	P35206	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	GPI18	P38211	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	OST3	P48439	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DPB2	YPR175W	STU1	P38198	1513 aa		4.59	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	SSO1	P32867	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	DRE2	P36152	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	UFD1	P53044	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	PSK1	P31374	1356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	SNT2	P53127	1403 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	GET1	P53192	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	MYO4	P32492	1471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	MET2	P08465	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	ATP7	P30902	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	SYS1	P41544	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	EMI1	Q04406	187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	GIM5	Q04493	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	FLO11	P08640	1367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	FRT2	P39734	528 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	AVT6	P40074	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	OSH6	Q02201	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	TIM22	Q12328	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	YGL262W	P53054	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	YGL118C	P53132	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	FUS2	Q05670	677 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	URA6	P15700	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	EPT1	P22140	391 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	DBF2	P22204	572 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	BRR6	P53062	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	MRX4	Q12467	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	ERG2	P32352	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	HEM25	Q07534	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	SWI1	P09547	1314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	SPS18	P32572	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	SLX1	P38324	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	PEX17	P40155	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	IRC18	P47056	224 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	PIN3	Q06449	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	YEL045C	P32616	141 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DPB2	YPR175W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	PCL1	P24867	279 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	PHO89	P38361	574 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	MIC19	P43594	170 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	PET191	Q02772	108 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	PDR10	P51533	1564 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	YHL044W	P38727	235 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	UFE1	P41834	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	FYV6	P53913	173 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	COX5A	P00424	153 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	OAC1	P32332	324 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	YIL001W	P40560	513 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DPB2	YPR175W	PDR17	P53844	350 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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