RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W REG2P38232 338 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W FSH1P38777 243 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HPA3P39979 161 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YNL194CP40169 301 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W FIS1P40515 155 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W IME4P41833 600 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YFL040WP43562 540 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PTR3P43606 678 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YHC3P47040 408 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MCM22P47167 239 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RHO5P53879 331 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ASI3P53983 676 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MOT3P54785 490 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YML018CQ03730 393 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SNO4Q04902 237 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HSP32Q08992 237 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W FRE8Q12209 686 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W LCB4Q12246 624 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PST1Q12355 444 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ATG5Q12380 294 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W GEP5Q12393 293 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MHT1Q12525 324 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W IZH4Q99393 312 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YLR462WO13556 202 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HIP1P06775 603 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W CDC21P06785 304 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W TIR1P10863 254 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SPT15P13393 240 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RFA3P26755 122 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YOR062CP36025 268 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W FRE2P36033 711 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PMU1P36069 295 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MRPL28P36527 147 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W GPX2P38143 162 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W POP8P38208 133 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W IML3P38265 245 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MIC12P38341 106 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MMS21P38632 267 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W DOG1P38774 246 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W GEP4P38812 185 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YPT35P38815 214 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YHR130CP38834 111 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MDM31P38880 579 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W VFA1P40080 203 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W LYS12P40495 371 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YIL012WP40551 113 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W BUD8P41698 603 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YFR057WP43625 151 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W FAR3P46671 204 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YJL118WP47022 219 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MGA1P53050 456 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W LST7P53237 242 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YNL092WP53934 400 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SUR7P54003 302 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HHT1P61830 136 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W CCE1Q03702 353 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W UPS3Q04006 179 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ASA1Q06822 443 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RAD28Q12021 506 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YLR126CQ12288 251 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SPE4Q12455 300 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W DET1Q99288 334 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PAI3P01094 68 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W AAC1P04710 309 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YER190C-BP0CX94 160 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YEL077W-AP0CX95 160 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YGR296C-BP0CX96 160 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YPL283W-BP0CX97 160 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YPR204C-AP0CX98 160 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W POX1P13711 748 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data3.06□□□□□ -1.92not detected
VFA1YER128W YMR31P19955 123 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HOM6P31116 359 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SGE1P33335 543 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W THI2P38141 450 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data3.06□□□□□ -1.92not detected
VFA1YER128W CUE1P38428 203 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PRE6P40303 254 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W AYR1P40471 297 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W BMT5P40493 336 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RPA43P46669 326 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W CIN2P46670 268 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ZAP1P47043 880 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MRPS16Q02608 121 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MAK3Q03503 176 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W CAB5Q03941 241 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RAV2Q03956 351 aa3.06□□□□□ -1.92
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