RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNG4Q9UBN1 327 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC26A4O43511 780 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 LYPLA2O95372 231 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 SLFN14P0C7P3 912 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMP2P13473 410 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ID4P47928 161 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 TYRO3Q06418 890 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 UVSSAQ2YD98 709 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 USP49Q70CQ1 688 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 IQUBQ8NA54 791 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RABGGTAQ92696 567 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 EPSTI1Q96J88 318 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 APOL6Q9BWW8 343 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB34Q9BZG1 259 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 DPP7Q9UHL4 492 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 FANCMQ8IYD8 2048 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL17P18621 184 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 GLRA2P23416 452 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP5P24588 427 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 SPECC1Q5M775 1068 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 NFKBIZQ9BYH8 718 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKD2Q9BZL6 878 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RBSNQ9H1K0 784 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 TPH2Q8IWU9 490 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PAAF1Q9BRP4 392 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 COLEC11Q9BWP8 271 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM28Q9UKQ2 775 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR179Q6PRD1 2367 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 COL4A3Q01955 1670 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 GLULP15104 373 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 USP41Q3LFD5 358 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RTP2Q5QGT7 225 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 GLYCTKQ8IVS8 523 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 R4GN57 208 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GUA9 196 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMYND10O75800 440 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 DCNP07585 359 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 UBA7P41226 1012 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 E2F4Q16254 413 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CUEDC2Q9H467 287 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ANO10Q9NW15 660 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 KLK14Q9P0G3 267 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 NUMBLQ9Y6R0 609 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIK3Q13003 919 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCL16Q9H2A7 254 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF3Q9NR81 526 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKEF1Q9NU02 776 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 SERTAD1Q9UHV2 236 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 STK24Q9Y6E0 443 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP250Q9BV73 2442 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WWV3 80 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 STK25O00506 426 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 DGAT1O75907 488 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 NPTXRO95502 500 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 LMNAP02545 664 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 RARRES1P49788 294 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TFDP1Q14186 410 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 STX1AQ16623 288 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC27A1Q6PCB7 646 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA20Q8TB22 786 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 CLSTN3Q9BQT9 956 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA4AQ9H3S1 761 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXW11Q9UKB1 542 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 POTEMA6NI47 508 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TTLL13PA6NNM8 815 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 NAB2Q15742 525 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF14Q92915 247 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 RMDN1Q96DB5 314 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PIDD1Q9HB75 910 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 NOTCH4Q99466 2003 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRN2O75325 713 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 MYL1P05976 194 aa26.43■■□□□ 1.82
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