RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa26.86■■□□□ 1.89
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CAPNS1-215ENST00000628018 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ALKAL1Q6UXT8 129 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 USP38Q8NB14 1042 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ELMO3Q96BJ8 720 aa26.81■■□□□ 1.88
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