RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A0G2JND7	137 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TNNC2	P02585	160 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RXRB	P28702	533 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PCK1	P35558	622 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	KRT81	Q14533	505 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MKL1	Q969V6	931 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CFAP36	Q96G28	342 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CHD4	Q14839	1912 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	YDJC	A8MPS7	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ICAM1	P05362	532 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PEX19	P40855	299 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PTEN	P60484	403 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RCN2	Q14257	317 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	KCTD6	Q8NC69	237 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TTC17	Q96AE7	1141 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF302	Q9NR11	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF8	O76064	485 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SAT1	P21673	171 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	UTRN	P46939	3433 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	COL4A1	P02462	1669 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	WNT10B	O00744	389 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	NEBL	O76041	1014 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP3A4	P08684	503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	VCAM1	P19320	739 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP3A7	P24462	503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	GTF2H1	P32780	548 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ITIH3	Q06033	890 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DNAJC3	Q13217	504 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	OPLAH	O14841	1288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	IL9R	Q01113	521 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	NCOA4	Q13772	614 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CLUL1	Q15846	466 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SNF8	Q96H20	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RILP	Q96NA2	401 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RGS7	P49802	495 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	FAXC	Q5TGI0	409 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	EMC1	Q8N766	993 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ITGB4	P16144	1822 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ETS1	P14921	441 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PRKCI	P41743	596 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ACTR2	P61160	394 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CDR2	Q01850	454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ALCAM	Q13740	583 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF699	Q32M78	642 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	FYB2	Q5VWT5	728 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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