RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTH2R	P49190	550 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BLOC1S1	P78537	153 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD69	Q07108	199 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FOXI1	Q12951	378 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	XYLT1	Q86Y38	959 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPON1	Q9HCB6	807 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNTG2	Q9NY99	539 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EP400	Q96L91	3159 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UNC119B	A6NIH7	251 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PCDH8	O95206	1070 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HLA-DOA	P06340	250 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NHLH2	Q02577	135 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DUSP2	Q05923	314 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DDB1	Q16531	1140 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	JMY	Q8N9B5	988 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLD2	O14939	933 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OPA1	O60313	960 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LY86	O95711	162 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ASL	P04424	464 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPATA31D3	P0C874	917 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLA2G5	P39877	138 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SERINC3	Q13530	473 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TEX101	Q9BY14	249 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TOMM22	Q9NS69	142 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UNC13B	O14795	1591 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIK3C2B	O00750	1634 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYPN	Q86TC9	1320 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TET3	O43151	1660 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ESRRB	O95718	433 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CAGE1	Q8TC20	777 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC9A6	Q92581	669 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TLK1	Q9UKI8	766 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTCH1	Q13635	1447 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KRTAP10-9	P60411	292 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TP53BP2	Q13625	1128 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIK3C2G	O75747	1445 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CBX4	O00257	560 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RBP3	P10745	1247 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CSNK2A1-208	ENST00000609525	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MGAT1	P26572	445 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FLT3	P36888	993 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MXRA7	P84157	204 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MPP3	Q13368	585 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYT12	Q8IV01	421 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TESK2	Q96S53	571 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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