RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 C1orf159Q96HA4 380 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 MTA3Q9BTC8 594 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 EMC7Q9NPA0 242 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 RLFQ13129 1914 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 MYH4Q9Y623 1939 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 NEDD4P46934 1319 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 BLACEA4D250 179 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 PGK2P07205 417 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 ALAS1P13196 640 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 TYRP1P17643 537 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC16A2P36021 539 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 MBTPS1Q14703 1052 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 SEC23AQ15436 765 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 ALFQ53S48 1182 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC174Q6PII3 467 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 MAML3Q96JK9 1138 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 PRR13Q9NZ81 148 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF536O15090 1300 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 FSCN2O14926 492 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC27A2O14975 620 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 MSCO60682 206 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNH1O95259 989 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ICAM1P05362 532 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ASGR2P07307 311 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 GOLGA8HP0CJ92 632 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 MCM5P33992 734 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNJ6P48051 423 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SNAP25P60880 206 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF4P78317 190 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 GUCY1A3Q02108 690 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ID3Q02535 119 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ADGRE1Q14246 886 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 WTAPQ15007 396 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ASPRV1Q53RT3 343 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PPM1JQ5JR12 505 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ANO1Q5XXA6 986 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 NXPE1Q8N323 547 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF214Q8ND24 703 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 TNIP3Q96KP6 325 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ACAD9Q9H845 621 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 JADE2Q9NQC1 790 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 LUZP4Q9P127 313 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 KLRF2D3W0D1 207 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SHOXO15266 292 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 CTSBP07858 339 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 AKAP5P24588 427 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 SERPINB3P29508 390 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-216ENST00000590105 GRIK1P39086 918 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms