RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM89A	Q96GI7	184 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ANO10	Q9NW15	660 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	BCL9	O00512	1426 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	MAST3	O60307	1309 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ERICH2	A1L162	156 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SMTNL1	A8MU46	457 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	DYNC1I1	O14576	645 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GSTA4	O15217	222 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PRC1	O43663	620 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	IL18BP	O95998	194 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	APP	P05067	770 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ADD2	P35612	726 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	HSPA2	P54652	639 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	STK3	Q13188	491 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	USP51	Q70EK9	711 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289		Q8TCH9	128 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXW5	Q969U6	566 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	C8orf76	Q96K31	380 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TIGD1	Q96MW7	591 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	DACT1	Q9NYF0	836 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	MYH3	P11055	1940 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ATRN	O75882	1429 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	BECN2	A8MW95	431 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ARVCF	O00192	962 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GPAA1	O43292	621 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	FZD7	O75084	574 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	XBP1	P17861	261 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ME1	P48163	572 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GABRE	P78334	506 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ST5	P78524	1137 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GUCY1A3	Q02108	690 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ST3GAL1	Q11201	340 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	STK38	Q15208	465 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CRY1	Q16526	586 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	DDB1	Q16531	1140 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	STX1A	Q16623	288 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SARM1	Q6SZW1	724 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	DRC7	Q8IY82	874 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA5	Q8NB90	893 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SCYL1	Q96KG9	808 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SDF4	Q9BRK5	362 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF747	Q9BV97	191 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	VPS11	Q9H270	941 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO10	Q9UK96	956 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58

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