RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932		A0A1W2PRU2	124 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZZEF1	O43149	2961 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	PROS1	P07225	676 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	POU2F2	P09086	479 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	DNM2	P50570	870 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	LIMK1	P53667	647 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRKCE	Q02156	737 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	ADCY1	Q08828	1119 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	FANCB	Q8NB91	859 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	PGBD1	Q96JS3	809 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	SAMM50	Q9Y512	469 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPEG	Q15772	3267 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	SMCO2	A6NFE2	343 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRC1	O43663	620 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	SFN	P31947	248 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	MCM5	P33992	734 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	CNR2	P34972	360 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	DSC1	Q08554	894 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	FZD5	Q13467	585 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	LONRF3	Q496Y0	759 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	TSSK4	Q6SA08	328 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	FGF13	Q92913	245 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHRD	Q9H2X0	955 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	DISC1	Q9NRI5	854 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	BARHL2	Q9NY43	387 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	F5	P12259	2224 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1L1-223	ENST00000576932	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	ECI2	O75521	394 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	POMC	P01189	267 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPATA31D3	P0C874	917 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	RXRA	P19793	462 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	CIITA	P33076	1130 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR1G1	P47890	313 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCR3	P51677	355 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	JAK3	P52333	1124 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	PTH1R	Q03431	593 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	MTAP	Q13126	283 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	DRP2	Q13474	957 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	AAMP	Q13685	434 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	TLR1	Q15399	786 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	USP41	Q3LFD5	358 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	IL31	Q6EBC2	164 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	RTL10	Q7L3V2	364 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	PALB2	Q86YC2	1186 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	RDM1	Q8NG50	284 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	DNASE1L2	Q92874	299 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	CEP89	Q96ST8	783 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	RIT2	Q99578	217 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	10.33	□□□□□ -0.76	3e-13	■■■■■ 279.4
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF358	Q9NW07	568 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	COL4A3	Q01955	1670 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	MAN2B1	O00754	1011 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPINT1	O43278	529 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	XYLB	O75191	536 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	CD72	P21854	359 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	NUCB1	Q02818	461 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	XKR3	Q5GH77	459 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	LIN9	Q5TKA1	542 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q6ZNB5	142 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		10.32	□□□□□ -0.76

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