RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571178.1

PAM16-202, Transcript of presequence translocase associated motor 16, humanhuman

TSL 3

Gene PAM16, Length 353 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAM16-202ENST00000571178 SLC44A3Q8N4M1 653 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ITFG1Q8TB96 612 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 EPSTI1Q96J88 318 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 SNX27Q96L92 541 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ACAP3Q96P50 834 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.147e-7■□□□□ 9.3
PAM16-202ENST00000571178 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 KIF3AQ9Y496 699 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 CFHP08603 1231 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 MCF2P10911 925 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PLCG1P19174 1290 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 TNFSF9P41273 254 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 CDR1P51861 262 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ARPP19P56211 112 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 TDGQ13569 410 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 GPBP1Q86WP2 473 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 FLCNQ8NFG4 579 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 CLIC6Q96NY7 704 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 REEP2Q9BRK0 252 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 FBXW11Q9UKB1 542 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 POLIQ9UNA4 740 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 CDY1Q9Y6F8 540 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 DMDP11532 3685 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 USP34Q70CQ2 3546 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa15.94■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 TISP43B9A030 160 aa15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PODXLO00592 558 aa15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 C8AP07357 584 aa15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 NMT1P30419 496 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 YARSP54577 528 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 SLC7A14Q8TBB6 771 aa15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 SNX21Q969T3 373 aa15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PANK2Q9BZ23 570 aa15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.93■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 KRBA1A5PL33 1030 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ANKRD63C9JTQ0 380 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PAPLNO95428 1278 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 SEC24AO95486 1093 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 CXCL8P10145 99 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 LAMP2P13473 410 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 KCNE1P15382 129 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 FSHRP23945 695 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 UBA7P41226 1012 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 STRN3Q13033 797 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 RAB33AQ14088 237 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PTPAQ15257 358 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PARM1Q6UWI2 310 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 HAUS6Q7Z4H7 955 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 GPR65Q8IYL9 337 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 SIX5Q8N196 739 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 MYCT1Q8N699 235 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 RAD54LQ92698 747 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ZHX3Q9H4I2 956 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 MTRRQ9UBK8 725 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 CA14Q9ULX7 337 aa15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 LACTBL1A8MY62 500 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PPEF2O14830 753 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 TOM1L1O75674 476 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 SYT1P21579 422 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 NCKAP1LP55160 1127 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 RESTQ13127 1097 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PPM1LQ5SGD2 360 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 SLC39A4Q6P5W5 647 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ING5Q8WYH8 240 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 FIZ1Q96SL8 496 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 C17orf75Q9HAS0 396 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 CNTN3Q9P232 1028 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 EPS15L1Q9UBC2 864 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PIEZO1Q92508 2521 aa15.91■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 C2orf16Q68DN1 1984 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms