RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569664.5

C16orf59-211, Transcript of Uncharacterized protein C16orf59, human

TSL 2

Gene C16orf59, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C16orf59-211	ENST00000569664	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		27.6	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	CCL16	O15467	120 aa		27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	PAPLN	O95428	1278 aa		27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	C8A	P07357	584 aa		27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	FGFR3	P22607	806 aa		27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	OR1D2	P34982	312 aa		27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	FLCN	Q8NFG4	579 aa		27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664		H0Y858	1186 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	CFH	P08603	1231 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	MCF2	P10911	925 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	PLS3	P13797	630 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	ARSH	Q5FYA8	562 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	XKR4	Q5GH76	650 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	LIN9	Q5TKA1	542 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	MTRR	Q9UBK8	725 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	POLI	Q9UNA4	740 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	COL4A3	Q01955	1670 aa		27.58	■■■□□ 2.01
C16orf59-211	ENST00000569664	PIEZO1	Q92508	2521 aa		27.58	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		27.57	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	ACAP3	Q96P50	834 aa		27.57	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	PRRX2	Q99811	253 aa		27.57	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		27.57	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		27.57	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		27.57	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	USP34	Q70CQ2	3546 aa		27.57	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	PODXL	O00592	558 aa		27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	C1R	P00736	705 aa		27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	NPR3	P17342	541 aa		27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	STRN3	Q13033	797 aa		27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	SIX5	Q8N196	739 aa		27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	UROC1	Q96N76	676 aa		27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		27.56	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	PI15	O43692	258 aa		27.55	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	LAMP2	P13473	410 aa		27.55	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	FSHR	P23945	695 aa		27.55	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	MCM2	P49736	904 aa		27.55	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	SPAG1	Q07617	926 aa		27.55	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	REEP2	Q9BRK0	252 aa		27.55	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	CNTN3	Q9P232	1028 aa		27.55	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	RAB33A	Q14088	237 aa		27.54	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	PDXDC1	Q6P996	788 aa		27.54	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	GPBP1	Q86WP2	473 aa		27.54	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		27.54	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		27.54	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	CA14	Q9ULX7	337 aa		27.54	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	TOM1L1	O75674	476 aa		27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	KCNE1	P15382	129 aa		27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	SMTN	P53814	917 aa		27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	ITFG1	Q8TB96	612 aa		27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		27.53	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		27.52	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	KRBA1	A5PL33	1030 aa		27.52	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	27.52	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	CXCL8	P10145	99 aa		27.52	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	PLCG1	P19174	1290 aa		27.52	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	TNFSF9	P41273	254 aa		27.52	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	NCKAP1L	P55160	1127 aa		27.52	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	HTR4	Q13639	388 aa		27.52	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	MCM6	Q14566	821 aa		27.52	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	BICD1	Q96G01	975 aa		27.52	■■■□□ 2
C16orf59-211	ENST00000569664	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	27.52	■■■□□ 2

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