RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.81■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.81■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.81■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 HPSEQ9Y251 543 aa20.81■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.81■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 MBTPS2O43462 519 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 ADSSP30520 456 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 NUCB2P80303 420 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 DSG1Q02413 1049 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 UPP1Q16831 310 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 ACCSQ96QU6 501 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.8■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.922e-11■■■■■ 62
EDC3-211ENST00000566243 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 TTC26A0AVF1 554 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 B3GAT3O94766 335 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SLFN14P0C7P3 912 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 EPCAMP16422 314 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 AFMP43652 599 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SPAG1Q07617 926 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 USP41Q3LFD5 358 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 RTP2Q5QGT7 225 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 CASP10Q92851 521 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 UROC1Q96N76 676 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 LACTBL1A8MY62 500 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 CUL4BQ13620 913 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 ALCAMQ13740 583 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 KYAT1Q16773 422 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.78■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 MYH11P35749 1972 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 PODXLO00592 558 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 TEX28O15482 410 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 ADRB2P07550 413 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 KLRC2P26717 231 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 ACOT2P49753 483 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 CLCN4P51793 760 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 NDUFA8P51970 172 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 EHHADHQ08426 723 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 UNC13DQ70J99 1090 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 PAGE5Q96GU1 130 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 APOL5Q9BWW9 433 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 S1PR5Q9H228 398 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.77■□□□□ 0.92
EDC3-211ENST00000566243 A0A1W2PQ27 194 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 A0A1W2PQ64 194 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 A0A1W2PQD8 194 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 I3L4J1 428 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 HOXD13P35453 343 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 BRCC3P46736 316 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 ZBTB6Q15916 424 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 GPR65Q8IYL9 337 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 FSIP1Q8NA03 581 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 KIF12Q96FN5 646 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 TTPALQ9BTX7 342 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 CD320Q9NPF0 282 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 FAM50BQ9Y247 325 aa20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
EDC3-211ENST00000566243 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms