RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-204	ENST00000561685	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	CLSTN1	O94985	981 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	GCSH	P23434	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	CXCR5	P32302	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	MASP1	P48740	699 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	SCAND1	P57086	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	MGAT2	Q10469	447 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	FOXI1	Q12951	378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	MAST3	O60307	1309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	EYA4	O95677	639 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	ELANE	P08246	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	ALAS1	P13196	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	OCA2	Q04671	838 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN3-204	ENST00000561685	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	MASP2	O00187	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	GPR39	O43194	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	GPR32	O75388	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	FGFR4	P22455	802 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	MPL	P40238	635 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	GPR3	P46089	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	MTNR1B	P49286	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	C21orf58	P58505	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	CXADR	P78310	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SCAP	Q12770	1279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685		K7ESF4	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	GPANK1	O95872	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	WNT10B	O00744	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	PRKD3	O94806	890 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	FPR1	P21462	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	CNGA1	P29973	690 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SLC6A9	P48067	706 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SEPT2	Q15019	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685		Q6ZNX1	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685		Q96MF0	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	MED15	Q96RN5	788 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	PNKP	Q96T60	521 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms