RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 LPPQ93052 612 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 BCO1Q9HAY6 547 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 HFM1A2PYH4 1435 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 A0A088AWK7 358 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 KLHL18O94889 574 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SLC5A1P13866 664 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 TM4SF4P48230 202 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 MEOX1P50221 254 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 STAT5BP51692 787 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 HK3P52790 923 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 NOGQ13253 232 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 RAB39AQ14964 217 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 ABHD15Q6UXT9 468 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 CLEC14AQ86T13 490 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 C3orf20Q8ND61 904 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SAMD11Q96NU1 681 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 GCM1Q9NP62 436 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.255e-17■■■■□ 22.7
TMOD3-208ENST00000560725 AFF2P51816 1311 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 LRP6O75581 1613 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SHPRHQ149N8 1683 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 FRS3O43559 492 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 RAB1AP62820 205 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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TMOD3-208ENST00000560725 MLANAQ16655 118 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 LONRF1Q17RB8 773 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 RSPH3Q86UC2 560 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 OR7D4Q8NG98 312 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 MYD88Q99836 296 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SGPP1Q9BX95 441 aa7.23□□□□□ -1.25
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TMOD3-208ENST00000560725 PTCH1Q13635 1447 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 PRAG1Q86YV5 1406 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 GASTP01350 101 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 MYL3P08590 195 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 CRHR1P34998 444 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 IL13P35225 146 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SLC6A9P48067 706 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 PER3P56645 1201 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 DLG4P78352 724 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 Q6ZVL8 140 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.22□□□□□ -1.25
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TMOD3-208ENST00000560725 TLR9Q9NR96 1032 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.21□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 CLTCL1P53675 1640 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-208ENST00000560725 MTSS1O43312 755 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-208ENST00000560725 ALDH1A2O94788 518 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-208ENST00000560725 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-208ENST00000560725 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-208ENST00000560725 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-208ENST00000560725 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-208ENST00000560725 FGL2Q14314 439 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF827Q17R98 1081 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-208ENST00000560725 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-208ENST00000560725 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.21□□□□□ -1.26
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